水产苗种运输是水产养殖中的一个重要环节，造成苗种运输和放养中伤亡的主要原因包括鱼苗缺氧、鱼体损伤以及途中的颠簸、水温的变化等因素影响。

运鱼用水

运输苗种的用水，只要是无污染、水质清新的河水、池水或水库水均可，要求水温基本一致，如果采用自来水，必须除氯后才能使用。运输中的水温与原水体中的水温的温差，水花苗不可超过1℃，规格苗种不能超过3℃。

停食并暂养

对要起运的鱼苗，要求选择体质健壮、无病无伤的鱼苗。水花苗尽量不投喂投运，规格苗种要提前暂养停食，这样可使苗种体内的粪便排除干净，降低鱼苗的代谢率，以免排入运输容器中污染水质，增强鱼苗的抗应激能力。

温度

在温度较低时运输和放养苗种成活率高，水温在15-20℃时运输和放养鱼苗最好。过低温度运送苗苗容易患发水霉病。若在夏季运输和放养，可以加冰块降温，但不能降温过大。