菌种在水产养殖中是非常常见的，也是常用的，而且每个菌种功效也是不一样的。其实用菌的主要目的就是调水的，当然还有一些菌是可以内服改善肠道。＂常用菌都有哪些下面就来讲一讲。首先了解一下菌的作用：

a、首先是水质改良和净化水质，这种菌以水体中的有机物、二氧化碳等作为碳源，以氨、氨盐、硝酸盐和亚硝酸盐等为氨源，所以光合菌可以有效降低氨氮和亚硝酸盐等有害物质；

b、其次菌可以作为鱼苗的天然饵料，能更好的被浮游生物捕食，从而培养更多的浮游生物，浮游生物又是鱼苗的天然饵料，而且光合菌营养丰富，蛋白含量高达58％，粗脂肪为7.9％，可溶性糖类为20.8％，并含有16种必需氨基酸

c、免疫增强剂预防鱼病，菌含有抗病毒因子及多种免疫促进因子，可活化机体的免疫系统：可释放具有抗病力的酵素对水体中可引起鱼、虾、贝类的细菌性疾病的病原体具有一定的抑制作用。

1、光合菌

光合菌（简称PSB），是地球上最早出现具有原始光能合成体系的原核生物，是在厌氧条件下进行不放氧光合作用的细菌的总称，其广泛存在于地球生物圈的各处。在水产养殖中能够降解水体中的亚硝酸盐、硫化物等有毒物质，实现充当饵料、净化水质、预防疾病、作为饲料添加剂等功能，它的诸多特性，使其在无公害水产养殖中具有巨大的应用价值。光合菌可以利用光进行光合作用但是不产氧的，它适应水温是15－40°C，最适宜的水温是28－36C。

2、复合芽抱杆菌

芽抱菌是一种耗氧菌，耐高温、耐挤压。芽跑菌在水产中的作用比较广泛，首先就是改善水质问题，芽抱可以分解水体中的大分子颗粒，把大分子颗粒分解为小分子颗粒；所以芽抱菌可以有效降低水体浓度，起到净化水质的作用。

3、硝化细菌

硝化细菌是一个可以有效降低氨氮和亚硝酸盐的自养型菌种，主要作用就是有效降低水体中的氨氮和亚硝酸盐。

4、EM菌

EM菌为有效微生物群的英文缩写，它是由光合细菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌、丝状菌等五大类菌群中80余种有益菌种复合培养而成。所以EM菌是调水稳水的主要菌种。

5、酵母菌

酵母细胞营养价值丰富，其中有机物含量占90－94％，还富舍多种维生素、矿物质和各种消化酶，含有多种色素和未知的活性物质。酵母菌主要用于饲料添加和净化水质。

6、乳酸菌

乳酸菌是一类能够利用可发酵性碳水化合物　（主要是糖类）　产生大量乳酸的无芽跑、革兰氏阳性细菌的总称；乳酸菌拌料能有效预防疾病，同时促进肠道吸收；同时还可有效分解养殖水体中的残饵、粪便等有机质，降低氨氮、亚硝酸盐和硫化氢等有害物质含量，净化水质。